Boa tarde @davi.rafacho,
Conforme a documentação indica, você deve enviar o binário do arquivo PFX ou P12 do certificado em base64.
Note que a codificação base64 é apenas para facilitar a transmissão de arquivos binários em meios que lidam apenas com texto, como é o caso de uma transmissão via JSON pela internet. O conteúdo original (após decodificar o texto em base64) do certificado deve ser um arquivo PFX ou P12. Caso ele esteja em outros formatos, como por exemplo o PEM, ocasionará erros.