O endpoint de inutilização de NFe exige o CNPJ do emitente, porém, como é possível emissão de NFe por CPF, também há a necessidade de Inutilização de notas emitidas por CPF.
Obs.: No ACBr permite tal ação: ACBr/pcnInutNFe.pas at 877e7a0df9f098373b65f342cf8e979548ba1310 · frones/ACBr · GitHub