Boa tarde, @rodrigo1.
Ao transmitir um RPS para a prefeitura, a Nuvem Fiscal o identifica de acordo com a próxima numeração disponível configurada para a empresa (Configuração de NFS-e). Caso a NFS-e seja aprovada, a API incrementa automaticamente essa numeração para que a próxima emissão a utilize. Caso a nota seja negada ou ocorra algum erro, a numeração permanece inalterada, e a próxima emissão utilizará o mesmo número que do RPS transmitido anteriormente.
Entretanto, especialmente em casos de erros de conexão (timeouts, erros nos servidores das prefeituras, indisponibilidades, etc), a Nuvem Fiscal não “desiste” imediatamente e possui mecanismos internos que fazem novas consultas e sincronizações com a prefeitura a fim de saber se o RPS foi efetivamente recepcionado por eles e qual a situação da emissão (autorizada ou negada). Isso tem ajudado a minimizar rejeições por duplicidade de RPS, por exemplo.
Para os demais casos, onde a API não conseguiu superar automaticamente situações adversas e/ou indisponibilidade das prefeituras, existe o endpoint de sincronização disponível para você forçar manualmente uma nova consulta de uma nota que esteja com o status de erro dentro da Nuvem Fiscal, porém autorizada na prefeitura.
Segue a documentação do endpoint de sincronização:
https://dev.nuvemfiscal.com.br/docs/api/#tag/Nfse/operation/SincronizarNfse